1964年

創立元培醫事技術專科學校

1965年

54學年度

正式招生「放射技術科」、「醫務管理科」、「醫事檢驗科」

1981年

70學年度原修業五年制改為修業六年制（含實習一年）

1991年

80學年度原修業六年制改為修業五年制（含實習半年）、

成立二年制「環境工程衛生科」及「食品衛生科」

1992年

81學年度設立「護理科」

1994年

83學年度設立二年制「醫學工程科」及「醫務管理科」

1995年

84學年度設立二年制夜間部及推廣教育中心

1999年

88學年度本校升格改制為元培科學技術學院

2000年

89學年度增設「資訊管理系」及「餐飲管理系」

2001年

食品衛生系改名為「食品科學系」

2002年

91學年度設立「資訊工程系」、「企業管理系」及「財務金融系」

2003年

92學年度設立「影像醫學研究所」、「生物技術研究所」及「經營管理研究所」

2005年

94學年度設立「生物技術系」

2006年

95學年度改名元培科技大學，設立「應用英語系」

2007年

96學年度

設立「環境工程衛生研究所」及「醫事技術研究所」、醫學工程系改名為「生物醫學工程系」、醫事技術系改名「醫學檢驗生物技術系」

2008年

97學年度

影像醫學研究所改名「放射技術研究所」

經營管理研究所改名「企業管理研究所」

醫事技術研究所改名「醫學檢驗生物研究所」

設立「應用保健食品研究所」、「光學科技系」

2009年

98學年度

應用保健食品研究所改名「食品科學研究所」

光學科技系改名「視光系」

2010年

99學年度

設立健康產業管理研究所、健康休閒管理系及福址科技學院

2011年

100學年度

設立數位創新管理研究所

生物技術系改名「生物科技系(所)」

財務金融系改名「應用財務管理系」

2012年

101學年度

放射技術系(所)改名「醫學影像暨放射技術系(所)」、增設「福祉科技與工程研究所」

2013年

102學年度

組織變更為「醫護與福祉學院」、「健康學院」、「產業與管理學院」

2014年

103學年度

更名元培醫事科技大學

生物技術系改名「生物科技暨製藥技術系」

設立「觀光與休閒管理系」

2015年

104學年度增設醫務管理系碩士在職專班

2016年

105學年度

資訊工程系改名「行動科技應用系」

設立高齡福祉事業管理學士學位學程

國際健康行銷學士學位學程

會展暨文創事業管理學士學位學程

網路與數位媒體應用學位學程

護理系四技進修部

視光科進修專校

2017年

106學年度

醫護與福祉學院更名為「醫護學院」

產業與管理學院更名為「福祉產業學院」

應用英語系更名為「應用外語系」

醫務管理系日間部四技分設醫療產業管理組及健康管理組

2018年

107學年度

增設寵物保健學士學位學程

2019年

108學年度

增設生技製藥產業博士學位學程

增設護理系碩士班日間碩士班

2020年

109學年度

會展暨文創事業管理學位學程更名為「茶陶文創學士學位學程」

設立茶陶文創碩士學位學程

醫務管理系日間部碩士班及碩士在職專班分設醫療機構管理組及健康照護管理組

2021年

110學年度

寵物保健學士學位學程改為「寵物保健系」

生物科技暨製藥技術系增設進修部四技

111學年度

設立應用外語學士學位學程

生物醫學工程系增設進修部四技